<br><div><br></div><div>Hi </div><div><span class="Apple-style-span" style="font-family: Times; font-size: medium; ">To Calculate the radii of gyration about the principal axes</span></div><div><span class="Apple-style-span" style="font-family: Times; font-size: medium; "><br>
</span></div><div><span class="Apple-style-span" style="font-family: Times; font-size: medium; ">I use the command</span></div><div><span class="Apple-style-span" style="font-family: Times; font-size: medium; ">g_gyrate -p</span></div>
<div><span class="Apple-style-span" style="font-family: Times; font-size: medium; "><br></span></div><div><span class="Apple-style-span" style="font-family: Times; font-size: medium; ">For lysozyme ,   I got  =&gt; </span></div>
<div><font class="Apple-style-span" face="Times"><span class="Apple-style-span" style="font-size: medium;">0.922754     1.22249     1.25603</span></font></div><div><span class="Apple-style-span" style="font-family: Times; font-size: medium; "><br>
</span></div><div><span class="Apple-style-span" style="font-family: Times; font-size: medium; ">but in some paper, the authors got </span></div><div><span class="Apple-style-span" style="font-family: Times; font-size: medium; ">=&gt; 0.660  0.833  0.991</span></div>
<div><span class="Apple-style-span" style="font-family: Times; font-size: medium; "><br></span></div><div><span class="Apple-style-span" style="font-family: Times; font-size: medium; ">It is a quite difference. </span></div>
<div><span class="Apple-style-span" style="font-family: Times; font-size: medium; "><br></span></div><div><span class="Apple-style-span" style="font-family: Times; font-size: medium; ">what is the definition of</span> the radii of gyration about the principal axes  ?</div>
<div>i have checked the Gromacs manual but see nothing there.</div><div><br></div><div><br></div><div>Thank you</div><div><br></div><div>Lin</div><div><br></div><div><br></div>