<html><body bgcolor="#FFFFFF"><div><br><br>On Aug 18, 2010, at 20:57, Rama G &lt;<a href="mailto:jujurama@yahoo.com">jujurama@yahoo.com</a>&gt; wrote:<br><br></div><div></div><blockquote type="cite"><div><div style="font-family:times new roman,new york,times,serif;font-size:12pt"><div>Hi guys,<br><br>I got a little shocked when I used the -e and -dt in g_hbond, why the default for - e is 0, on manual it says "-e" means "last frame to read from trajectory". I know "-b" means "First frame to read from trajectory" with default 0, why do both default values are the same, and both from 0. <br></div></div></div></blockquote>Zero will indicate the end of the trajectory.&nbsp;<br><blockquote type="cite"><div><div style="font-family:times new roman,new york,times,serif;font-size:12pt"><div><br>And can anyone explain a little bit about -dt to me? MOD means modulate?<br></div></div></div></blockquote>Mod means modulo! -dt XX will select the conformations that are spaced by XX ps starting at time given by -b option.&nbsp;<br><blockquote type="cite"><div><div style="font-family:times new roman,new york,times,serif;font-size:12pt"><div><br>Thanks,<br><br>Juju <br></div>
</div><br>

      </div></blockquote><blockquote type="cite"><div><span>-- </span><br><span>gmx-users mailing list &nbsp;&nbsp;&nbsp;<a href="mailto:gmx-users@gromacs.org"><a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a></a></span><br><span><a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a></span><br><span>Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/search">http://www.gromacs.org/search</a> before posting!</span><br><span>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the </span><br><span>www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.</span><br><span>Can't post? Read <a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php"><a href="http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php">http://www.gromacs.org/mailing_lists/users.php</a></a></span></div></blockquote></body></html>