<br>----- Original Message -----<br>From: pojeda@icp.uni-stuttgart.de<br>Date: Wednesday, August 25, 2010 19:16<br>Subject: [gmx-users] Installating GROMACS with MPI<br>To: gmx-users@gromacs.org<br><br>&gt; Hi,<br>&gt; <br>&gt; I am installing GROMACS with the mpi option. There is some <br>&gt; problem with the<br>&gt; flags of pgcc. The version of pgcc is<br>&gt; <br>&gt; pgcc 7.0-5 64-bit target on x86-64 Linux.<br>&gt; <br>&gt; and that of gromacs gromacs-4.5-beta2.<br>&gt; <br>&gt; I can remove the flags by hand but I dont know if this procedure will<br>&gt; modify the performance of GROMACS.<br><br>Looks like your MPI library is configured to use either a different compiler, or the same compiler differently. If you use the same one, things should be fine. <br><br>Also, troubleshoot your installation procedure with GROMACS 4.0.7, rather than a beta.<br><br>Alternatively, use gcc for both, since GROMACS performance is fairly compiler-independent.<br><br>Mark