<br><br>----- Original Message -----<br>From: vivek sharma &lt;viveksharma.iitb@gmail.com&gt;<br>Date: Wednesday, August 25, 2010 16:48<br>Subject: [gmx-users] Lysozyme benchmarking for gromacs-4,0.5<br>To: Discussion list for GROMACS users &lt;gmx-users@gromacs.org&gt;<br><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>Hi there,<br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>I am running a GROMACS benchmarking on my cluster with the Lysozyme example provided in benchmarking files. I am looking at ns/day to compare the performance of various runs. <br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>I am using gromacs-4.0.5, Can somebody provide me with the figures to compare the performance? Also DO I need to take other parameters than ns/day like PP/PME load imbalance to compare the performance?<br><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;"></font>The GROMACS 4 paper has some relevant benchmark results.<br><br>Mark