<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html><head><title>Re[2]: [gmx-users] initial velocities analysis</title>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-1">
<meta http-equiv="Content-Style-Type" content="text/css">
<style type="text/css"><!--
body {
  margin: 5px 5px 5px 5px;
  background-color: #ffffff;
}
/* ========== Text Styles ========== */
hr { color: #000000}
body, table /* Normal text */
{
 font-size: 9pt;
 font-family: 'Courier New';
 font-style: normal;
 font-weight: normal;
 color: #000000;
 text-decoration: none;
}
span.rvts1 /* Heading */
{
 font-size: 10pt;
 font-family: 'Arial';
 font-weight: bold;
 color: #0000ff;
}
span.rvts2 /* Subheading */
{
 font-size: 10pt;
 font-family: 'Arial';
 font-weight: bold;
 color: #000080;
}
span.rvts3 /* Keywords */
{
 font-size: 10pt;
 font-family: 'Arial';
 font-style: italic;
 color: #800000;
}
a.rvts4, span.rvts4 /* Jump 1 */
{
 font-size: 10pt;
 font-family: 'Arial';
 color: #008000;
 text-decoration: underline;
}
a.rvts5, span.rvts5 /* Jump 2 */
{
 font-size: 10pt;
 font-family: 'Arial';
 color: #008000;
 text-decoration: underline;
}
span.rvts6
{
 font-weight: bold;
 color: #800000;
}
span.rvts7
{
 font-weight: bold;
 color: #800080;
}
a.rvts8, span.rvts8
{
 color: #0000ff;
 text-decoration: underline;
}
span.rvts9
{
 font-weight: bold;
 color: #800080;
}
span.rvts10
{
 font-size: 8pt;
 font-family: 'arial';
 font-style: italic;
 color: #c0c0c0;
}
a.rvts11, span.rvts11
{
 font-size: 8pt;
 font-family: 'arial';
 color: #0000ff;
 text-decoration: underline;
}
/* ========== Para Styles ========== */
p,ul,ol /* Paragraph Style */
{
 text-align: left;
 text-indent: 0px;
 padding: 0px 0px 0px 0px;
 margin: 0px 0px 0px 0px;
}
.rvps1 /* Centered */
{
 text-align: center;
}
--></style>
</head>
<body>

<p>Hi, Justin.</p>
<p><br></p>
<p>I'm also interested in this question. Could you make clear:</p>
<p><br></p>
<p><span class=rvts6>&gt; Anna Marabotti wrote:</span></p>
<p><span class=rvts7>...</span></p>
<p><span class=rvts7>&gt;&gt; - is there a way to check for the velocities or for the random seed&nbsp;</span></p>
<p><span class=rvts7>&gt;&gt; used? I had a look at the .log file but I didn't find the information.&nbsp;</span></p>
<p><span class=rvts7>&gt;&gt; g_traj generated a very big file, and presently I have some problems to&nbsp;</span></p>
<p><span class=rvts7>&gt;&gt; analyze it. How can I see initial velocities?</span></p>
<p><span class=rvts7>&gt;&gt; &nbsp;</span></p>
<p>...</p>
<p><br></p>
<p>In other words, when gen_seed is set to -1, there is a rigorous rule for seed calculation. How can I get the value of this seed? I need it to repeat exactly the same run, e.g., with more detailed outputs.</p>
<p><span class=rvts10>--&nbsp;</span></p>
<p><span class=rvts10>Regards,</span></p>
<p><span class=rvts10>&nbsp;Dmitri &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;</span><a class=rvts11 href="mailto:ddubov@ngs.ru">mailto:ddubov@ngs.ru</a></p>

</body></html>