<br><br>----- Original Message -----<br>From: zhongjin &lt;zhongjin1000@yahoo.com.cn&gt;<br>Date: Tuesday, August 31, 2010 18:23<br>Subject: [gmx-users] Fatal error when using do_dssp<br>To: gmx-users@gromacs.org<br><br><table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0"><tbody><tr><td style="font: inherit;" valign="top"><div><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>Hi,</div> <div><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>&nbsp;I have installed the dsspcmbi, and then add "&nbsp;export&nbsp; DSSP=/home/hzj1000/dssp"，I can use dsspcmbi.But when I use do_dssp, came across the following error:</div> <div><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>Failed to execute command: /usr/local/bin/dssp -na ddS7CWeR dd48KVro <br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>&gt;<i> /dev/null 2&gt; /dev/null</i></div> <div><em></em><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;"></font><br>You might be trying to set the environment variable the wrong way for your shell, or not in the right window or not to the right value. See http://www.gromacs.org/Documentation/Gromacs_Utilities/do_dssp<br><br>Mark<br></div></td></tr></tbody></table>