<br><br>----- Original Message -----<br>From: rekkha nivethitha &lt;rnnive@gmail.com&gt;<br>Date: Thursday, September 2, 2010 14:35<br>Subject: [gmx-users] Interactions regarding<br>To: gmx-users@gromacs.org<br><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br clear="all"><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>Hi..<br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>I have simulated protein-protein complex using gromacs.<br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>Now, i have to see the interactions between the protein-protein complex.<br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font><br><font style="font-style: normal; font-weight: normal; background-color: rgb(245, 248, 240); font-size: 14px;">&gt; </font>How to see the interactions of active site residues.&nbsp; Is there any molecular viewer available for this study.<br><br>Viewing things is fairly easy. See http://www.gromacs.org/index.php?title=Download_%26_Installation/Related_Software/Visualization_Software<br><br>Quantifying anything is harder.<br><br>Mark