<div> </div>
<div>HI </div>
<div> </div>
<div>Residues PHE, TRP, TYR, and HIS are carrying &quot;Rings&quot;, or say pi bonds.</div>
<div> </div>
<div>
<div>How does the Gromacs deal with polarity for all this four residues?</div>
<div> </div>
<div>Is a single charge assigned for each atom on the center of atoms of the four residues ?</div>
<div> </div>
<div>Is pi bond given for the four residues in the force field?</div>
<div> </div>
<div> </div>
<div>Thank you</div>
<div>Lin</div>
<div> </div>
<div> </div></div>