Hi,<br><br>ques1:<br>I have 3 energy groups.<br>I am interested in using tables for LJ and coulomb  interactions for Group1-group2 interactions. <br>For all other interactions:<br>1) Group1-group1 -all interactions-bonded and non-bonded<br>

2) Group2-group2 -all interactions -bonded and non-bonded<br>3) All possible combinations for group3<br>I want to use gromacs defined standard energy functions.<br><br>For all other types of interactions, e.g. 1-4 pair interactions and bonded interactions I would like to use gromacs defined interactions. <br>

<br>And for all these cases, I am still looking to use parameters defined by the forcefield. I would like to specify that I am will be using a functional form in the tables differing from coulomb and 6-12 LJ interactions by a numeric constant.<br>

<br>Is it possible? If not entirely, which is possible? Any suggestions on which part might be easier to program?<br><br><br><br>Pooja<br><br>Quaerendo Invenietis-Seek and you shall discover.<br>