Dear experts,<br><br>I have installed newest version of gromacs (4.5) on our cluster. When I issue the command below to test installation I get an error about atom type CU+2. I am not using such atom type at all! Could you please help me what wrong is. Thanks.<br>
<br><br>grompp -f *.mdp -c *.gro -p *.top -o out &gt;&amp; output.grompp_md<br><br><br>NOTE 1 [file md-NVT-revised.mdp]:<br>  nstcomm &lt; nstcalcenergy defeats the purpose of nstcalcenergy, setting<br>  nstcomm to nstcalcenergy<br>
<br>Generated 332520 of the 332520 non-bonded parameter combinations<br>Generating 1-4 interactions: fudge = 0.5<br>Generated 332520 of the 332520 1-4 parameter combinations<br><br>-------------------------------------------------------<br>
Program grompp, VERSION 4.5<br>Source code file: toppush.c, line: 1166<br><br>Fatal error:<br>Atomtype CU2+ not found<br>For more information and tips for troubleshooting, please check the GROMACS<br>website at <a href="http://www.gromacs.org/Documentation/Errors">http://www.gromacs.org/Documentation/Errors</a><br>
-------------------------------------------------------<br><br>