<div>Gromacs is running well on multi-nodes without nwall. But with nwall, it doesn&#39;t work.<br></div>
<div>Yi<br></div>
<div class="gmail_quote">On Thu, Sep 9, 2010 at 9:28 PM, Mark Abraham <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:mark.abraham@anu.edu.au">mark.abraham@anu.edu.au</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="PADDING-LEFT: 1ex; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; BORDER-LEFT: #ccc 1px solid">
<div>
<div></div>
<div class="h5"><br><br>----- Original Message -----<br>From: Yi Gao &lt;<a href="mailto:t218gy@gmail.com" target="_blank">t218gy@gmail.com</a>&gt;<br>Date: Friday, September 10, 2010 12:23<br>Subject: [gmx-users] parallel run problem for nwall<br>
To: <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br><br>
<div><font style="FONT-WEIGHT: normal; FONT-SIZE: 14px; FONT-STYLE: normal; BACKGROUND-COLOR: rgb(245,248,240)">&gt; </font>Dear Sir,</div>
<div><font style="FONT-WEIGHT: normal; FONT-SIZE: 14px; FONT-STYLE: normal; BACKGROUND-COLOR: rgb(245,248,240)">&gt; </font> </div></div></div>
<div>
<div>
<div></div>
<div class="h5"><font style="FONT-WEIGHT: normal; FONT-SIZE: 14px; FONT-STYLE: normal; BACKGROUND-COLOR: rgb(245,248,240)">&gt; </font>I am using nwall to run my system. My version is Gromacs 4.0.7. Interestingly, I could parallel run my system on 1 node with 4 or 8 cpus, but when I run it on multi-node PC-cluster, it always fails and gives no message at all. I wonder if you could help me to resolve this problem? Thanks a lot!<br>
<br></div></div>First, find out if your MPI is configured to use the multiple nodes, e.g. with a hostfile.<br><br>Mark<br></div><br>--<br>gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br>
</blockquote></div><br>