<br><br>----- Original Message -----<br>From: Yao Yao &lt;yao0o@ymail.com&gt;<br>Date: Saturday, September 11, 2010 10:00<br>Subject: [gmx-users] OWT5 not found in Charmmff<br>To: gmx-users@gromacs.org<br><br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; I am running tip5p in charmm force field in gmx. In energy <br>&gt; minimization step, it gives an error msg as below. I just simply <br>&gt; added it in atomtypes.atp in charmm27.ff, but still it doesn't <br>&gt; work. Does anyone know how to solve it?<br><br>Depends what you've done. My instructions about copying the charmm27.ff directory should have worked. More than tip5p.itp is required, and it has to go where pdb2gmx will find it - either in the local copy of the directory, or in the $GMXLIB version..<br><br>Mark<br><br><br>&gt; -------------------------------------------------------<br>&gt; &gt; Program grompp, VERSION 4.5-beta3<br>&gt; &gt; Source code file: toppush.c, line: 1166<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt; Fatal error:<br>&gt; &gt; Atomtype OWT5 not found<br>&gt; &gt; For more information and tips for troubleshooting, please<br>&gt; &gt; check the GROMACS<br>&gt; &gt; website at http://www.gromacs.org/Documentation/Errors<br>&gt; &gt; ------------------------------------------------------<br>&gt; &gt; <br>&gt; &gt;&gt;<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>&gt; <br>&gt; -- <br>&gt; gmx-users mailing list&nbsp;&nbsp;&nbsp; gmx-users@gromacs.org<br>&gt; http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users<br>&gt; Please search the archive at <br>&gt; http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search before posting!<br>&gt; Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the <br>&gt; www interface or send it to gmx-users-request@gromacs.org.<br>&gt; Can't post? Read http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists