<br><br>----- Original Message -----<br>From: "Poojari, Chetan" &lt;c.poojari@fz-juelich.de&gt;<br>Date: Thursday, September 16, 2010 20:33<br>Subject: RE: [gmx-users] rerun warning<br>To: Discussion list for GROMACS users &lt;gmx-users@gromacs.org&gt;<br><br>&gt; Hello Mark,<br>&gt; <br>&gt; Thank you very much for quick reply.<br>&gt; <br>&gt; I am looking for LJ and coul interactions, please can i know <br>&gt; what can be done to avoid these warnings if incase i want to <br>&gt; calculate kinetic quantities...<br><br>These are not kinetic quantities. They depend on positions of atoms, not velocities. If you need velocity-dependent data then you have no option but to rerun the trajectory, saving velocity coordinates suitably. But it sounds to me like you don't need to.<br><br>Mark