<br><br>----- Original Message -----<br>From: Fabio Affinito &lt;f.affinito@cineca.it&gt;<br>Date: Tuesday, September 21, 2010 18:51<br>Subject: Re: [gmx-users] error on compilation on BlueGene/P<br>To: Discussion list for GROMACS users &lt;gmx-users@gromacs.org&gt;<br><br>&gt; Thank you, Mark and Berk!<br>&gt; your suggestion was helpful and I successfully compiled on the <br>&gt; frontend.Now I have a problem when I compile on the compute nodes.<br>&gt; Configure was fine with these parameters:<br>&gt; <br>&gt; ../configure --prefix=/bgp/userinternal/cin0644a/gromacs \<br>&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; --host=ppc --build=ppc64 --enable-ppc-sqrt=1 \<br>&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; --disable-ppc-altivec \<br>&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; --enable-bluegene --enable-fortran --enable-mpi \<br>&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; --with-fft=fftw3 \<br>&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; --program-suffix=_mpi_bg \<br>&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; --without-x \<br>&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; CC=mpixlc_r \<br>&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; CFLAGS="-O3 -qarch=450d -qtune=450" \<br>&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; MPICC=mpixlc_r CXX=mpixlC_r \<br>&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; CXXFLAGS="-O3 -qarch=450d -qtune=450" \<br>&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; CPPFLAGS="-I/bgp/userinternal/cin0644a/fftwlibs/include" \<br>&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; F77=mpixlf77_r FFLAGS="-O3 -qarch=auto -qtune=auto" \<br>&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; LDFLAGS="-L/bgp/userinternal/cin0644a/fftwlibs/lib" \<br>&gt; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; LIBS="-lmass"<br>&gt; <br>&gt; But when I compile using "make mdrun" the compilation stops in <br>&gt; this way.<br>&gt; <br>&gt; creating libgmxpreprocess_mpi.la<br>&gt; (cd .libs &amp;&amp; rm -f libgmxpreprocess_mpi.la &amp;&amp; ln -s<br>&gt; ../libgmxpreprocess_mpi.la libgmxpreprocess_mpi.la)<br>&gt; make[1]: *** No rule to make target `../mdlib/libmd_mpi.la', <br>&gt; needed by<br>&gt; `mdrun'.&nbsp; Stop.<br>&gt; make[1]: Leaving directory <br>&gt; `/bgp/userinternal/cin0644a/gmx/bgp/src/kernel'<br>&gt; Any suggestion? Thanks!<br><br><br>Normally that would be symptomatic of an earlier error in make (or maybe configure). Please check carefully.<br><br>Mark