<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;"><br><blockquote style="border-left: 2px solid rgb(16, 16, 255); margin-left: 5px; padding-left: 5px;"><br><div class="plainMail">Hi Gmxers,<br><br>Sorry, Eric and David, <br><br>I cannot transfer my trr file to report a bug because of its huge size.<br>It is just a regular protein with 70 Angstrom cubic TIP5P water box in Charmm27 force field. That's all of the system.<br><br>But anyway, i included the mdp file in the attachment.<br><br>Hopefully someone can help me.<br><br>Many thanks,<br><br>Yao&nbsp; <br><br><br><br><br>--- On Wed, 9/29/10, Erik Marklund &lt;<a ymailto="mailto:erikm@xray.bmc.uu.se" href="/mc/compose?to=erikm@xray.bmc.uu.se">erikm@xray.bmc.uu.se</a>&gt; wrote:<br><br>&gt; From: Erik Marklund &lt;<a ymailto="mailto:erikm@xray.bmc.uu.se" href="/mc/compose?to=erikm@xray.bmc.uu.se">erikm@xray.bmc.uu.se</a>&gt;<br>&gt; Subject: Re: [gmx-users]
 g_hbond segmentation fault<br>&gt; To: "Discussion list for GROMACS users" &lt;<a ymailto="mailto:gmx-users@gromacs.org" href="/mc/compose?to=gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a>&gt;<br>&gt; Date: Wednesday, September 29, 2010, 7:55 AM<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;Hi,<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;Could you file a bugzilla and attach the trr and tpr<br>&gt; files please?<br>&gt;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;If you do I'll try to sort it out today or at least<br>&gt; this week.<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;Erik<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;Yao Yao skrev 2010-09-29 08.22:<br>&gt;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt;&nbsp; &nbsp;
 &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;I tried without -dt or -e, still the same<br>&gt; problem exists<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;in either case.<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;Thanks,<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;
 &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;Yao<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;--- On Wed, 9/29/10, David van der Spoel<br>&gt; &lt;<a ymailto="mailto:spoel@xray.bmc.uu.se" href="/mc/compose?to=spoel@xray.bmc.uu.se">spoel@xray.bmc.uu.se</a>&gt;<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;wrote:<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;From: David van der Spoel &lt;<a ymailto="mailto:spoel@xray.bmc.uu.se" href="/mc/compose?to=spoel@xray.bmc.uu.se">spoel@xray.bmc.uu.se</a>&gt;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;
 &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;Subject: Re: [gmx-users] g_hbond<br>&gt; segmentation fault<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;To: "Discussion list for GROMACS<br>&gt; users"<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&lt;<a ymailto="mailto:gmx-users@gromacs.org" href="/mc/compose?to=gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a>&gt;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;Date: Wednesday, September 29, 2010, 6:11<br>&gt; AM<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;On<br>&gt; 2010-09-29 08.02, Yao Yao<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;wrote:<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;
 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; Hi Gmxers,<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; I used the command line,<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; g_hbond -f tst.trr -s tst.tpr -ac<br>&gt; test -e 500<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;-dt 1<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; and I got the message like,<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt;
 <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;try without the -dt 1<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt; ----------------------------------<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; Found 1048 different hydrogen<br>&gt; bonds in<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;trajectory<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; Found 2292 different atom-pairs<br>&gt; within hydrogen<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;bonding distance<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;
 Merging hbonds with Acceptor and<br>&gt; Donor swapped<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; 2/10915 *Segmentation fault*<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt; __________________________________<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; Anyone knows what could be the<br>&gt; reason for this<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;Segmentation Fault ?<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; A couple of Q's I am also<br>&gt; curious,<br>&gt;
 <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; why do we need to swap Acceptors<br>&gt; and Acceptors<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;when merging hbonds?<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; Does gromacs suggest that the<br>&gt; number of<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;different hydrogen bonds in<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; trajectory<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; should be the same as
 that of<br>&gt; different<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;atom-pairs within hydrogen<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; bonding distance?<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; Thanks,<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt; Yao<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;
 &nbsp;&nbsp;&nbsp;&gt;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;-- <br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;David van der Spoel, Ph.D., Professor<br>&gt; of Biology<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;Dept. of Cell &amp; Molec. Biol.,<br>&gt; Uppsala<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;University.<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;Box 596, 75124 Uppsala, Sweden.<br>&gt; Phone:&nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;
 &nbsp;&nbsp;&nbsp;+46184714205.<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<a ymailto="mailto:spoel@xray.bmc.uu.se" href="/mc/compose?to=spoel@xray.bmc.uu.se">spoel@xray.bmc.uu.se</a>&nbsp;<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <a href="http://folding.bmc.uu.se" target="_blank">http://folding.bmc.uu.se</a><br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;-- <br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;gmx-users mailing list&nbsp; &nbsp; <a ymailto="mailto:gmx-users@gromacs.org" href="/mc/compose?to=gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users"
 target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a><br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;before posting!<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;Please don't post (un)subscribe<br>&gt; requests to the<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;list. Use the <br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;www interface or send it to <a ymailto="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" href="/mc/compose?to=gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>&gt;
 <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;Can't post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt;&nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt; <br>&gt;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp;-- <br>&gt; -----------------------------------------------<br>&gt; Erik Marklund, PhD student<br>&gt;
 Dept. of Cell and Molecular Biology, Uppsala University.<br>&gt; Husargatan 3, Box 596,&nbsp; &nbsp; 75124 Uppsala, Sweden<br>&gt; phone:&nbsp; &nbsp; +46 18 471 4537&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; fax: +46 18 511 755<br>&gt; <a ymailto="mailto:erikm@xray.bmc.uu.se" href="/mc/compose?to=erikm@xray.bmc.uu.se">erikm@xray.bmc.uu.se</a><br>&gt;&nbsp; &nbsp; <a href="http://folding.bmc.uu.se/" target="_blank">http://folding.bmc.uu.se/</a><br>&gt; <br>&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;<br>&gt; <br>&gt; <br>&gt; -----Inline Attachment Follows-----<br>&gt; <br>&gt; -- <br>&gt; gmx-users mailing list&nbsp; &nbsp; <a ymailto="mailto:gmx-users@gromacs.org" href="/mc/compose?to=gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>&gt; <a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>&gt; Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search"
 target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a><br>&gt; before posting!<br>&gt; Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use<br>&gt; the <br>&gt; www interface or send it to <a ymailto="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" href="/mc/compose?to=gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>&gt; Can't post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br><br><br>&nbsp; &nbsp; &nbsp; </div></blockquote></td></tr></table><br>