I recommend to use Linux inside a Virtualbox (<a href="http://www.virtualbox.org/">http://www.virtualbox.org/</a>) over Cygwin. Cygwin is rather slow.<div><br></div><div>We should have a Virtual Appliance with GROMACS installed ...<br>

<br><div class="gmail_quote">On Tue, Oct 5, 2010 at 11:42 PM, Justin A. Lemkul <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:jalemkul@vt.edu">jalemkul@vt.edu</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">

<div class="im"><br>
<br>
#ZHAO LINA# wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
sudo apt-get install grace<br>
</blockquote>
<br></div>
For Linux sure, but I think the Cygwin equivalent is something like cyg-get (which is probably not standard) and there may or may not be a &quot;grace&quot; package available.<br><font color="#888888">
<br>
-Justin</font><div><div></div><div class="h5"><br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<br>
________________________________________<br>
From: <a href="mailto:gmx-users-bounces@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-bounces@gromacs.org</a> [<a href="mailto:gmx-users-bounces@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-bounces@gromacs.org</a>] on behalf of Justin A. Lemkul [<a href="mailto:jalemkul@vt.edu" target="_blank">jalemkul@vt.edu</a>]<br>


Sent: Wednesday, October 06, 2010 11:29 AM<br>
To: Gromacs Users&#39; List<br>
Subject: Re: [gmx-users] Re : installation of gromacs in windows on cygwin<br>
<br>
bharat gupta wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
thanks for ur help.. I have figured out the problem and not installation<br>
is going on .. I want to know one more thing that xmgrace which is<br>
required for plotting the data .. how can we install it as I have<br>
searched on google .. but  I am not able to get the correct link<br>
<br>
</blockquote>
<br>
The first Google result for &quot;xmgrace&quot; is the site you want, I don&#39;t know what<br>
else to tell you.<br>
<br>
<a href="http://plasma-gate.weizmann.ac.il/Grace/" target="_blank">http://plasma-gate.weizmann.ac.il/Grace/</a><br>
<br>
Follow whatever documentation they provide to install it.<br>
<br>
-Justin<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
--<br>
Bharat<br>
Ph.D. Candidate<br>
Room No. : 7202A, 2nd Floor<br>
Biomolecular Engineering Laboratory<br>
Division of Chemical Engineering and Polymer Science<br>
Pusan National University<br>
Busan -609735<br>
South Korea<br>
Lab phone no. - +82-51-510-3680, +82-51-583-8343<br>
Mobile no. - 010-5818-3680<br>
E-mail : <a href="mailto:monu46010@yahoo.com" target="_blank">monu46010@yahoo.com</a> &lt;mailto:<a href="mailto:monu46010@yahoo.com" target="_blank">monu46010@yahoo.com</a>&gt;<br>
<br>
</blockquote>
<br>
--<br>
========================================<br>
<br>
Justin A. Lemkul<br>
Ph.D. Candidate<br>
ICTAS Doctoral Scholar<br>
MILES-IGERT Trainee<br>
Department of Biochemistry<br>
Virginia Tech<br>
Blacksburg, VA<br>
jalemkul[at]<a href="http://vt.edu" target="_blank">vt.edu</a> | (540) 231-9080<br>
<a href="http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin" target="_blank">http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin</a><br>
<br>
========================================<br>
--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br>
</blockquote>
<br>
-- <br>
========================================<br>
<br>
Justin A. Lemkul<br>
Ph.D. Candidate<br>
ICTAS Doctoral Scholar<br>
MILES-IGERT Trainee<br>
Department of Biochemistry<br>
Virginia Tech<br>
Blacksburg, VA<br>
jalemkul[at]<a href="http://vt.edu" target="_blank">vt.edu</a> | (540) 231-9080<br>
<a href="http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin" target="_blank">http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin</a><br>
<br>
========================================<br>
-- <br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br>
</div></div></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>ORNL/UT Center for Molecular Biophysics <a href="http://cmb.ornl.gov">cmb.ornl.gov</a><br>865-241-1537, ORNL PO BOX 2008 MS6309<br>
</div>