Hi<br><br>In the post-processing ( analysis) code using gromacs trajectory, I access force values on atom using fr.x[indx_atm][XX]. The confusion I have is that &quot; what force is it? is it the force before constraints ( fixed bonds) are applied or is it the effective force due to atom-atom interactions plus any constraints?&quot;<br>
<br>thanks<br>sikandar<br>