<br>Could anyone please clarify on my previous question? I am very confused about the force value issue. <br><br>thanks<br>sikandar<br><div class="gmail_quote">On Thu, Oct 7, 2010 at 2:27 PM, Sikandar Mashayak <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:symashayak@gmail.com">symashayak@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">Hi<br><br>In the post-processing ( analysis) code using gromacs trajectory, I access force values on atom using fr.x[indx_atm][XX]. The confusion I have is that &quot; what force is it? is it the force before constraints ( fixed bonds) are applied or is it the effective force due to atom-atom interactions plus any constraints?&quot;<br>

<br>thanks<br><font color="#888888">sikandar<br>
</font></blockquote></div><br>