Dear Leila<br>Yes,I think so<br>please read the article who I pointed,It can help you<br><br><br><div class="gmail_quote">On Sat, Oct 16, 2010 at 12:16 PM, leila karami <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:karami.leila1@gmail.com">karami.leila1@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;"> <pre style="font-family: arial,helvetica,sans-serif;">Dear mohsen ramezanpour<br><br><br>my pdb file has 3000atoms (protein) + 1 atom (calcium).<br>
<br>Should I separate ion from general pdb again?     <br><br><br><br></pre>
<br>--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br></blockquote></div><br>