<html><head><style type="text/css"><!-- DIV {margin:0px;} --></style></head><body><div style="font-family:arial,helvetica,sans-serif;font-size:10pt"><div style="font-family: arial,helvetica,sans-serif; font-size: 10pt; color: rgb(0, 0, 0);"><div>Hi,<br><br>I've got a top2psf.pl script from the web and used it to generate a psf file. Yet it generated&nbsp; some bonds to atoms with index 0 which should not occur.&nbsp; It causes VMD cannot load it and had a segmentation fault.&nbsp; <br><br><span style="font-style: italic;">vmd &gt; Info) Using plugin psf for structure file /home/birg/Desktop/zz.psf</span><br style="font-style: italic;"><span style="font-style: italic;">
ERROR) Error reading bond information.</span><br style="font-style: italic;"><span style="font-style: italic;">Segmentation fault</span><br><br>I wonder am I getting the right top2psf.pl.&nbsp; Or is there any place I can get the latest stable version of that script? <br><br>Here, I attached the perl script I used.<br><br>Thanks.<br><br>Regards,<br>Joyce<br> </div>
</div>
</div><br></body></html>