<html><head></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; "><div><div>On Oct 20, 2010, at 5:17 AM, Son Tung Ngo wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><div class="gmail_quote">Dear experts,<div><br></div><div>I have just install gromacs 4.5.1 on my cluster (using CentOS that was install openmpi1.5, Platform MPI, fftw3, g77, gcc , g++) but I have problem with size of int :</div>
<div><span style="font-family:'Times New Roman';font-size:medium">&nbsp;</span></div>
<div><div>[root@icstcluster gromacs-4.5.1]# ./configure --prefix=/shared/apps/gromacs --enable-mpi --enable-double&nbsp;</div><div>&lt;snip&gt;</div><div>checking for _aligned_malloc... no</div><div><b><span style="background-color:rgb(255, 153, 102)">checking size of int... 0</span></b></div>
<div><b><span style="background-color:rgb(255, 153, 102)">checking size of long int... 0</span></b></div><div><b><span style="background-color:rgb(255, 153, 102)">checking size of long long int... 0</span></b></div>
<div><b><span style="background-color:rgb(255, 153, 102)">checking size of off_t... configure: error: in `/shared/apps/source/gromacs-4.5.1':</span></b></div><div>configure: error: cannot compute sizeof (off_t)</div>

<div><br></div><div>Any idea about this?</div></div></div></blockquote></div>Hi Son,<div><br></div><div>search the config.log file for your error message "cannot compute sizeof (off_t)".</div><div>There you can find some more explanation. Could be a missing library.</div><div><br></div><div>Carsten</div></body></html>