<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;">Dear Justin<br><br>Actually, what I want to do is to kill the attraction part of the LJ substrate-polymer interaction. So, I was thinking to put the cut-off equal the 1,12σ (point with the lowest energy). <br><br>Do you have any other idea how can I have only the repulsion part? <br><br>If not, can you suggest me a further reading about how to use tabulated potentials?<br><br>-Many thanks, Chrysostomos<br><br>--- Στις <b>Παρ., 22/10/10, ο/η Justin A. Lemkul <i>&lt;jalemkul@vt.edu&gt;</i></b> έγραψε:<br><blockquote style="border-left: 2px solid rgb(16, 16, 255); margin-left: 5px; padding-left: 5px;"><br>Από: Justin A. Lemkul &lt;jalemkul@vt.edu&gt;<br>Θέμα: Re: [gmx-users] LJ cut-off distance<br>Προς: "Discussion list for GROMACS users" &lt;gmx-users@gromacs.org&gt;<br>Ημερομηνία: Παρασκευή, 22 Οκτώβριος
 2010, 17:51<br><br><div class="plainMail"><br><br>C. Batistakis wrote:<br>&gt; Dear all<br>&gt; <br>&gt; I have a system of polymer chains between 2 substrates. The substrates are FCC lattices consisting of Lennard-Jones particles.&nbsp; <br>&gt; I would like to know if it’s possible to handle individually the cut-off distances of the LJ interactions in the system<br>&gt; <br>&gt; For example, I would to use one cut-off distance for the LJ interactions between the particles of the substrate but a different cut-off distance for the LJ interaction between the substrate and the polymers. Is this possible?<br>&gt; <br><br>No.&nbsp; There can be only one value of rvdw.&nbsp; If you want custom potentials, you can use tabulated potentials, but I don't think this directly addresses what you want to do.<br><br>-Justin<br><br>&gt; Many thanks in advance<br>&gt; <br>&gt; Chrysostomos<br>&gt; <br>&gt; <br><br>--
 ========================================<br><br>Justin A. Lemkul<br>Ph.D. Candidate<br>ICTAS Doctoral Scholar<br>MILES-IGERT Trainee<br>Department of Biochemistry<br>Virginia Tech<br>Blacksburg, VA<br>jalemkul[at]vt.edu | (540) 231-9080<br><a href="http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin" target="_blank">http://www.bevanlab.biochem.vt.edu/Pages/Personal/justin</a><br><br>========================================<br>-- gmx-users mailing list&nbsp; &nbsp; <a ymailto="mailto:gmx-users@gromacs.org" href="/mc/compose?to=gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br><a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use
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