<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;">Hi,<div>&nbsp;&nbsp;I was wondering whether gromacs can calculate a quantity called molecular surface area(MSA) which is different from solvent accessible surface area(SASA).</div><div><br></div><div>By definition, SASA of a molecule is the area of surface traced by center of a spherical water probe rolling on a vander wall surface of the given molecule. I think g_sas provides SASA.</div><div><br></div><div>But MSA is something different. It is the area generated by the part of the probe surface facing the given molecule. But, I am not sure whether gromacs can calculate it .</div><div><br></div><div>Jagannath</div></td></tr></table><br>