Thank you very much for the input Ivan.<br><br><div class="gmail_quote">On Mon, Oct 25, 2010 at 5:46 AM, Ivan Gladich <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:igladich@purdue.edu">igladich@purdue.edu</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">
Dear Amit<br>
As far as I know, 3-body interaction potential is not defined in<br>
gromacs. If you want to introduce it in Gromacs, you have to change the<br>
source code. It is not easy but not impossible and it was already done<br>
for TIP4P, see Kumar and Skinner, J. Phys. Chem. B, 112,8311-8318, 2008<br>
<br>
I hope this help<br>
Ivan<br>
<div><div></div><div class="h5"><br>
Amit Choubey wrote:<br>
&gt; Hi all,<br>
&gt;<br>
&gt; I was wondering if there is a way to define user defined potential which<br>
&gt; involves 3 particles. Thank you for any input.<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
&gt; Amit<br>
&gt;<br>
&gt;<br>
<br>
<br>
</div></div>--<br>
-------<br>
Ivan Gladich, Ph.D.<br>
<br>
Dreyfus Postdoctoral Fellow<br>
Department of Chemistry<br>
Purdue University<br>
560 Oval Drive, box 140<br>
West Lafayette<br>
IN 47906 USA<br>
<br>
Room: 265C<br>
Tel:765-494-5225<br>
e-mail: <a href="mailto:igladich@purdue.edu">igladich@purdue.edu</a><br>
web page: <a href="http://web.ics.purdue.edu/~igladich/" target="_blank">http://web.ics.purdue.edu/~igladich/</a><br>
<br>
--------<br>
<font color="#888888">--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br>
</font></blockquote></div><br>