<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html><head><title>Re: [gmx-users] Radius of Gyration</title>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=utf-8">
<meta http-equiv="Content-Style-Type" content="text/css">
<style type="text/css"><!--
body {
  margin: 5px 5px 5px 5px;
  background-color: #ffffff;
}
/* ========== Text Styles ========== */
hr { color: #000000}
body, table /* Normal text */
{
 font-size: 9pt;
 font-family: 'Courier New';
 font-style: normal;
 font-weight: normal;
 color: #000000;
 text-decoration: none;
}
span.rvts1 /* Heading */
{
 font-size: 10pt;
 font-family: 'Arial';
 font-weight: bold;
 color: #0000ff;
}
span.rvts2 /* Subheading */
{
 font-size: 10pt;
 font-family: 'Arial';
 font-weight: bold;
 color: #000080;
}
span.rvts3 /* Keywords */
{
 font-size: 10pt;
 font-family: 'Arial';
 font-style: italic;
 color: #800000;
}
a.rvts4, span.rvts4 /* Jump 1 */
{
 font-size: 10pt;
 font-family: 'Arial';
 color: #008000;
 text-decoration: underline;
}
a.rvts5, span.rvts5 /* Jump 2 */
{
 font-size: 10pt;
 font-family: 'Arial';
 color: #008000;
 text-decoration: underline;
}
span.rvts6
{
 font-size: 11pt;
 font-family: 'tahoma';
 font-weight: bold;
 color: #ffffff;
 background-color: #0000ff;
}
span.rvts7
{
 font-size: 11pt;
 font-family: 'tahoma';
}
span.rvts8
{
 font-family: 'tahoma';
 vertical-align: super;
}
span.rvts9
{
 font-size: 8pt;
 font-family: 'arial';
 font-style: italic;
 color: #c0c0c0;
}
a.rvts10, span.rvts10
{
 font-size: 8pt;
 font-family: 'arial';
 color: #0000ff;
 text-decoration: underline;
}
/* ========== Para Styles ========== */
p,ul,ol /* Paragraph Style */
{
 text-align: left;
 text-indent: 0px;
 padding: 0px 0px 0px 0px;
 margin: 0px 0px 0px 0px;
}
.rvps1 /* Centered */
{
 text-align: center;
}
.rvps2
{
 text-align: justify;
}
--></style>
</head>
<body>

<p>Hi, C..</p>
<p><br></p>
<p>You wrote 1 ноября 2010 г., 22:09:36:</p>
<p><br></p>
<div><table border=0 cellpadding=1 cellspacing=2>
<tr valign=top>
<td width=12 style="background-color: #0000ff;">
<p><span class=rvts6>&gt;</span></p>
</td>
<td width=607 style="background-color: #ffffff;">
<div><table border=0 cellpadding=0 cellspacing=0>
<tr valign=top>
<td width=607 style="background-color: #ffffff;">
<p class=rvps2><span class=rvts7>Does someone knows which equation is g_gyrate using to calculate the Rgx, Rgy, Rgz components of the Rg and which is the relation between them?</span></p>
<p class=rvps2><br></p>
<p class=rvps2><span class=rvts7>I thougth that it was: Rg</span><span class=rvts8>2</span><span class=rvts7>=Rgx</span><span class=rvts8>2</span><span class=rvts7>+Rgy</span><span class=rvts8>2</span><span class=rvts7>+Rgz</span><span class=rvts8>2</span><span class=rvts7>, but at least for my results this is not the case.</span></p>
</td>
</tr>
</table>
</div>
</td>
</tr>
</table>
</div>
<p><br></p>
<p>Sure, this is not the case. You could see the definition of Rg in Manual, Chapter 8 (Analysis).</p>
<p>The definition of Rg_x contains y_i^2 + z_i^2 instead of ||r_i||^2 = x_i^2 + y_i^2 + z_i^2.</p>
<p>Similarly, R_y and R_z contain x_i^2 + z_i^2 and x_i^2 + y_i^2.</p>
<p><br></p>
<p>Thus it is easy to get</p>
<p>Rg_x^2 + Rg_y^2 + Rg_z^2 = 2 Rg^2</p>
<p><span class=rvts9>--&nbsp;</span></p>
<p><span class=rvts9>Regards,</span></p>
<p><span class=rvts9>&nbsp;Dmitri &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp;</span><a class=rvts10 href="mailto:ddubov@ngs.ru">mailto:ddubov@ngs.ru</a></p>

</body></html>