<div>Dear Justin</div>
<div> </div>
<div>thanks for your attentions</div>
<div> </div>
<div>In my case, after md simulation my protein diffuse out from one side of box. for solution I used trjconv -pbc nojump. then problem fixed but box disappears and water molecules recedes from protein.</div>
<div> </div>
<div><br> </div>