<div>When using the charmm forcefield, the following is the case:</div>
<div> </div>
<div>1. ffnonbonded.itp - has listed paramters for tip3p (and other water models) OWT3  and HWT3</div>
<div>2. ffbonded.itp - does not have paramters for OWT3 and HWT3</div>
<div> </div>
<div>Does this mean:</div>
<div> </div>
<div>1. nonbonded parameters for tip3p are read from ffnonbonded.itp for ALL nonbonded interactions OR</div>
<div>for water-water interactions are read from tip3p.itp file and for protein-water are read from ffnonbonded.itp?</div>
<div> </div>
<div>2.bonded paramters for tip3p are read from tip3p.itp file?</div>
<div> </div>
<div>Pooja</div>
<div><br clear="all"><br>-- <br>Quaerendo Invenietis-Seek and you shall discover.<br></div>