<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;">Hi Gmxers,<div><br></div><div>Is that possible that in mdp file, only a specifically-targeted part inside/of the protein is energy minimized (EM)? Like, just wanna EM the ligand or one out of the two proteins in protein-docking.</div><div><br></div><div>Thanks in advance,</div><div><br></div><div>Yao</div></td></tr></table><br>