<DIV>Dear all gmxers,<BR>I meet some problems when I use the tabulated bonded potential.<BR>My original function is a sum of An*cos(x)^n (n=1-8).For short here I replaced it by cos(x). <BR>if f(x)=cos(x),then -f'(x)=sin(x).and the numberical derivative -f'(x)=-(y(n+1)-y(n-1))/2.<BR>but there are great discrepancy between the two -f'(x).<BR>which is right?<BR>and if mdrun with the derivative of original function I would met a warning:the forces deviate </DIV>
<DIV>on average 207% from minus the numerical derivative of the potential.but mdrun with the the </DIV>
<DIV>numberical derivative there is no warning.</DIV><br><br><span title="neteasefooter"><span id="netease_mail_footer"></span></span>