Hi,<br><br>I installed in /usr/local/bin the DSSP program. And I set the environment variable with a command such as “export DSSP=/usr/local/bin/dssp”.<br>ab@ubuntu:/Desktop/work# do_dssp -s run.tpr -f run.xtc<br>...<br>Selected 1: &#39;Protein&#39;<br>

There are 164 residues in your selected group<br>Opening library file /usr/share/gromacs/top/ss.map<br>Reading frame       0 time    0.000   <br>Back Off! I just backed up dduigjCp to ./#dduigjCp.1#<br><br>-------------------------------------------------------<br>

Program do_dssp, VERSION 4.0.5<br>Source code file: ../../../../src/tools/do_dssp.c, line: 471<br><br><b>Fatal error:</b><br>Failed to execute command: /usr/local/bin/dssp -na dduigjCp ddDsSuzR &gt; /dev/null 2&gt; /dev/null<br>

-------------------------------------------------------<br>&quot;Jesus Not Only Saves, He Also Frequently Makes Backups.&quot; (Myron Bradshaw)<br><br>What should I do?<br><br>Thanks in advance<br><br>-- <br>Ahmet YILDIRIM<br>