<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body text="#000000" bgcolor="#ffffff">
    On 13/11/2010 9:12 PM, atila petrosian wrote:
    <blockquote
      cite="mid:AANLkTi=Y284GtGUM+dec19e8e1si+_Sn1faBXu51L=0G@mail.gmail.com"
      type="cite">
      <div>Dear all</div>
      <div>&nbsp;</div>
      <div>my system includes protein, ligand and water. </div>
      <div>&nbsp;</div>
      <div>
        <p class="MsoNormal" style="margin: 0in 0in 0pt; text-align:
          justify;"><font size="3"><span style="font-family: 'Times New
              Roman','serif';">I want to obtain number of water
              molecules (interfacial)&nbsp;&nbsp;to be within 2.4 A distance from
              both the protein and the ligand during simulation. also,
              exact numeration of each water being in interface between
              protein and ligand.</span></font></p>
      </div>
    </blockquote>
    <br>
    Look at the new g_select in GROMACS 4.5.x<br>
    <br>
    Mark<br>
  </body>
</html>