<span style="font-family: arial,helvetica,sans-serif;">Dear Erik and Justin</span><br><br>Thank you so much for ypur help.<br style="font-family: arial,helvetica,sans-serif;"><br style="font-family: arial,helvetica,sans-serif;">
<span style="font-family: arial,helvetica,sans-serif;">yes I mean water mediated hydrogen bonds (protein-H2O-dna)</span>.<br><br>since I&#39;m beginner in perl script, please clarify your answer and explain more. what is your mean of <br>
existence functions exactly?<br><br>do using of -ins option in g_hbond tool help me?<br style="font-family: arial,helvetica,sans-serif;"><br style="font-family: arial,helvetica,sans-serif;" clear="all"><br>-- <br><pre style="font-family: arial,helvetica,sans-serif;">
Leila Karami<br>Ph.D. student of Physical Chemistry<br>K.N. Toosi University of Technology<br>Theoretical Physical Chemistry Group</pre><br>