<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=GB2312" http-equiv="Content-Type">
    <title></title>
  </head>
  <body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
    Hi all,<br>
    <br>
    I just recompiled GMX4.0.7. Such error doesn't occur. But 4.0.7 is
    about 30% slower than 4.5.3. So I really appreciate if anyone can
    help me with it!<br>
    <br>
    best regards,<br>
    Baofu Qiao<br>
    <br>
    <br>
    ÓÚ 2010-11-25 20:17, Baofu Qiao Ð´µÀ:
    <blockquote cite="mid:4CEEA833.80702@gmail.com" type="cite">
      <meta http-equiv="content-type" content="text/html;
        charset=GB2312">
      Hi all,<br>
      <br>
      I got the error message when I am extending the simulation using
      the following command:<br>
      mpiexec -np 64 mdrun -deffnm pre -npme 32 -maxh 2 -table table
      -cpi pre.cpt -append <br>
      <br>
      The previous simuluation is succeeded. I wonder why pre.log is
      locked, and the strange warning of "<big><b>Function not
          implemented</b></big>"?<br>
      <br>
      Any suggestion is appreciated!<br>
      <br>
*********************************************************************<br>
      Getting Loaded...<br>
      Reading file pre.tpr, VERSION 4.5.3 (single precision)<br>
      <br>
      Reading checkpoint file pre.cpt generated: Thu Nov 25 19:43:25
      2010<br>
      <br>
      -------------------------------------------------------<br>
      Program mdrun, VERSION 4.5.3<br>
      Source code file: checkpoint.c, line: 1750<br>
      <br>
      Fatal error:<br>
      <big><b>Failed to lock: pre.log. Function not implemented.</b></big><br>
      For more information and tips for troubleshooting, please check
      the GROMACS<br>
      website at <a moz-do-not-send="true"
        class="moz-txt-link-freetext"
        href="http://www.gromacs.org/Documentation/Errors">http://www.gromacs.org/Documentation/Errors</a><br>
      -------------------------------------------------------<br>
      <br>
      "It Doesn't Have to Be Tip Top" (Pulp Fiction)<br>
      <br>
      Error on node 0, will try to stop all the nodes<br>
      Halting parallel program mdrun on CPU 0 out of 64<br>
      <br>
      gcq#147: "It Doesn't Have to Be Tip Top" (Pulp Fiction)<br>
      <br>
--------------------------------------------------------------------------<br>
      MPI_ABORT was invoked on rank 0 in communicator MPI_COMM_WORLD<br>
      with errorcode -1.<br>
      <br>
      NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI
      processes.<br>
      You may or may not see output from other processes, depending on<br>
      exactly when Open MPI kills them.<br>
--------------------------------------------------------------------------<br>
--------------------------------------------------------------------------<br>
      mpiexec has exited due to process rank 0 with PID 32758 on<br>
      <br>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>