<br /><br /><span>On 12/05/10, <b class="name">ms </b> &lt;devicerandom@gmail.com&gt; wrote:</span><blockquote cite="mid:4CFAD8D3.2060708@gmail.com" class="iwcQuote" style="border-left: 1px solid rgb(0, 0, 255); padding-left: 13px; margin-left: 0pt;" type="cite"><div class="mimepart text plain">Hi,<br /><br />Sorry for the offtopic but my google-fu is apparently abandoning me. I am looking for a fast way to generate random coil protein configurations to use as startpoints for several simulations I'd like to do.<br /><br />All I managed to find is:<br />- FOLDTRAJ which seems unavailable and discontinued<br />- the server at unfolded.uchicago.edu, which actual working part ( <a href="http://z-appserver.cti.depaul.edu/~unfolded/start.html" target="l">http://z-appserver.cti.depaul.edu/~unfolded/start.html</a> ) seems unavailable as well.<br /><br />Anyone has working suggestions for that? I am quite sure there must be such a package, yet I can't find it... dumb me probably.</div></blockquote><br />I dunno if it will help, but Googling with &quot;self-avoiding Gaussian walk&quot; might help - since that's what a random coil is.<br /><br />Mark