Dear users<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Here is my problem:<br>&nbsp; &nbsp; &nbsp; I just changed my GMX version from 4.0 to 4.5.<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; But the task was in a Segmentation fault, whileI can "mdrun" it well in 4.0 environment .<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Here is the error:<br><br><br><br><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; Step 1902, time 1.902 (ps)&nbsp; LINCS WARNING<br>relative constraint deviation after LINCS:<br>rms 1057.527961, max 39594.472656 (between atoms 5543 and 5541)<br>bonds that rotated more than 30 degrees:<br>&nbsp;atom 1 atom 2&nbsp; angle&nbsp; previous, current, constraint length<br><br>Step 1902, time 1.902 (ps)&nbsp; LINCS WARNING<br>relative constraint deviation after LINCS:<br>rms 598.238330, max 39421.507812 (between atoms 5544 and 5546)<br>bonds that rotated more than 30 degrees:<br>&nbsp;atom 1 atom 2&nbsp; angle&nbsp; previous, current, constraint length<br>&nbsp;&nbsp; 2136&nbsp;&nbsp; 2138&nbsp;&nbsp; 32.4&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1759&nbsp;&nbsp; 0.1096&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 6874&nbsp;&nbsp; 6869&nbsp;&nbsp; 44.6&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1103&nbsp;&nbsp; 0.1082&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1082<br>&nbsp;&nbsp; 5728&nbsp;&nbsp; 5727&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1111&nbsp;&nbsp; 0.2223&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1090<br>&nbsp;&nbsp; 7024&nbsp;&nbsp; 7023&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1111&nbsp;&nbsp; 0.1591&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1090<br>&nbsp;&nbsp; 7025&nbsp;&nbsp; 7023&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1111&nbsp;&nbsp; 2.7347&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1090<br>&nbsp;&nbsp; 7027&nbsp;&nbsp; 7026&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 2.7603&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 7028&nbsp;&nbsp; 7026&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 1.7013&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 7029&nbsp;&nbsp; 7030&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1559&nbsp;&nbsp; 0.2336&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 7029&nbsp;&nbsp; 7031&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.2080&nbsp;&nbsp; 2.4955&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 8377&nbsp;&nbsp; 8376&nbsp;&nbsp; 41.3&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 0.1095&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 8385&nbsp;&nbsp; 8382&nbsp; 143.8&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1115&nbsp;&nbsp; 2.5694&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1094<br>&nbsp;&nbsp; 8384&nbsp;&nbsp; 8382&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1115&nbsp;&nbsp; 0.2055&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1094<br>&nbsp;&nbsp; 5684&nbsp;&nbsp; 5682&nbsp;&nbsp; 42.6&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 0.1096&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 8383&nbsp;&nbsp; 8382&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1115&nbsp;&nbsp; 0.2720&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1094<br>&nbsp;&nbsp; 5436&nbsp;&nbsp; 5435&nbsp;&nbsp; 34.8&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1113&nbsp;&nbsp; 2.4639&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1092<br>&nbsp;&nbsp; 5437&nbsp;&nbsp; 5435&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1113&nbsp;&nbsp; 0.8917&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1092<br>&nbsp;&nbsp; 5438&nbsp;&nbsp; 5435&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1113&nbsp;&nbsp; 0.2059&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1092<br>&nbsp;&nbsp; 5530&nbsp;&nbsp; 5525&nbsp;&nbsp; 95.5&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1637&nbsp; 46.5184&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1082<br>&nbsp;&nbsp; 5536&nbsp;&nbsp; 5535&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1111&nbsp; 63.8121&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1090<br>&nbsp;&nbsp; 5537&nbsp;&nbsp; 5535&nbsp; 110.7&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1111&nbsp;&nbsp; 2.1859&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1090<br>&nbsp;&nbsp; 5539&nbsp;&nbsp; 5538&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 5.2483&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 5540&nbsp;&nbsp; 5538&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 0.5557&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 5542&nbsp;&nbsp; 5541&nbsp; 105.9&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 4.8490&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 5543&nbsp;&nbsp; 5541&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118 4340.0601&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 5480&nbsp;&nbsp; 5473&nbsp;&nbsp; 54.7&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1103&nbsp;&nbsp; 0.1082&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1082<br>&nbsp;&nbsp; 5545&nbsp;&nbsp; 5544&nbsp;&nbsp; 89.4&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp; 18.5327&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 5544&nbsp;&nbsp; 5546&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.2399 4321.1011&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 5245&nbsp;&nbsp; 5243&nbsp;&nbsp; 36.6&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1113&nbsp;&nbsp; 0.1093&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1092<br>&nbsp;&nbsp; 2794&nbsp;&nbsp; 2789&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1103&nbsp;&nbsp; 0.3056&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1082<br>&nbsp;&nbsp; 4160&nbsp;&nbsp; 4158&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1115&nbsp;&nbsp; 0.1108&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1094<br>&nbsp;&nbsp; 8456&nbsp;&nbsp; 8449&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1103&nbsp;&nbsp; 3.7825&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1082<br>&nbsp;&nbsp; 7029&nbsp;&nbsp; 7030&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1559&nbsp;&nbsp; 0.2336&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 4520&nbsp;&nbsp; 4513&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1103&nbsp;&nbsp; 0.2065&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1082<br>&nbsp;&nbsp; 7029&nbsp;&nbsp; 7031&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.2080&nbsp;&nbsp; 2.4955&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 7033&nbsp;&nbsp; 7032&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 2.6289&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 7034&nbsp;&nbsp; 7032&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 0.4015&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 4524&nbsp;&nbsp; 4523&nbsp;&nbsp; 65.1&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1113&nbsp;&nbsp; 0.1091&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1092<br>&nbsp; 10281&nbsp; 10276&nbsp;&nbsp; 68.7&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1105&nbsp;&nbsp; 0.1083&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1083<br>&nbsp;&nbsp; 7041&nbsp;&nbsp; 7038&nbsp;&nbsp; 35.7&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1115&nbsp;&nbsp; 0.1094&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1094<br>&nbsp;&nbsp; 2136&nbsp;&nbsp; 2138&nbsp;&nbsp; 32.4&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1759&nbsp;&nbsp; 0.1096&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp; 10282&nbsp; 10277&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1103&nbsp;&nbsp; 0.1607&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1082<br>&nbsp; 10288&nbsp; 10287&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1111&nbsp;&nbsp; 0.3496&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1090<br>&nbsp;&nbsp; 5544&nbsp;&nbsp; 5546&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.2399 4321.1011&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 5544&nbsp;&nbsp; 5545&nbsp;&nbsp; 89.4&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp; 18.5327&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 5548&nbsp;&nbsp; 5547&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 1.0539&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 5549&nbsp;&nbsp; 5547&nbsp;&nbsp; 48.5&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 0.1038&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 2800&nbsp;&nbsp; 2799&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1111&nbsp;&nbsp; 2.8513&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1090<br>&nbsp;&nbsp; 2801&nbsp;&nbsp; 2799&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1111&nbsp;&nbsp; 0.6884&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1090<br>&nbsp; 10291&nbsp; 10290&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 0.1451&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 3520&nbsp;&nbsp; 3519&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1111&nbsp;&nbsp; 1.1565&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1090<br>&nbsp;&nbsp; 3521&nbsp;&nbsp; 3519&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1111&nbsp;&nbsp; 0.7086&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1090<br>&nbsp;&nbsp; 3525&nbsp;&nbsp; 3526&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.2190&nbsp; 12.9248&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 3525&nbsp;&nbsp; 3527&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1127&nbsp;&nbsp; 0.1825&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 5494&nbsp;&nbsp; 5493&nbsp;&nbsp; 50.9&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 0.1038&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 5495&nbsp;&nbsp; 5493&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 1.3247&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 8460&nbsp;&nbsp; 8459&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1113&nbsp;&nbsp; 1.3661&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1092<br>&nbsp;&nbsp; 8461&nbsp;&nbsp; 8459&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1113&nbsp;&nbsp; 0.2465&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1092<br>&nbsp;&nbsp; 8462&nbsp;&nbsp; 8459&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1113&nbsp;&nbsp; 0.2054&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1092<br>&nbsp;&nbsp; 3525&nbsp;&nbsp; 3526&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.2190&nbsp; 12.9248&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 3525&nbsp;&nbsp; 3527&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1127&nbsp;&nbsp; 0.1825&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 4528&nbsp;&nbsp; 4527&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1111&nbsp;&nbsp; 1.1331&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1090<br>&nbsp;&nbsp; 4529&nbsp;&nbsp; 4527&nbsp;&nbsp; 32.8&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1111&nbsp;&nbsp; 0.1132&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1090<br>&nbsp;&nbsp; 4531&nbsp;&nbsp; 4530&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 0.1824&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 4532&nbsp;&nbsp; 4530&nbsp;&nbsp; 40.4&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 3.0513&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 4535&nbsp;&nbsp; 4533&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 0.1212&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp; 10280&nbsp; 10273&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1103&nbsp;&nbsp; 0.3980&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1082<br>&nbsp;&nbsp; 6648&nbsp;&nbsp; 6649&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 2.0258&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 6653&nbsp;&nbsp; 6651&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 1.9735&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 6657&nbsp;&nbsp; 6654&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1115&nbsp;&nbsp; 2.2662&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1094<br>&nbsp;&nbsp; 4522&nbsp;&nbsp; 4517&nbsp;&nbsp; 46.8&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1103&nbsp;&nbsp; 0.1082&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1082<br>&nbsp;&nbsp; 6646&nbsp;&nbsp; 6645&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1117&nbsp;&nbsp; 1.3712&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 6985&nbsp;&nbsp; 6984&nbsp;&nbsp; 41.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 0.1096&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 3529&nbsp;&nbsp; 3528&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 0.1886&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 3530&nbsp;&nbsp; 3528&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 0.1834&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 2991&nbsp;&nbsp; 2992&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.2281&nbsp; 61.6154&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1090<br>&nbsp;&nbsp; 2991&nbsp;&nbsp; 2993&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1982&nbsp;&nbsp; 0.3326&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1090<br>&nbsp;&nbsp; 6647&nbsp;&nbsp; 6645&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 0.6161&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 6649&nbsp;&nbsp; 6648&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 2.0258&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 2997&nbsp;&nbsp; 2998&nbsp;&nbsp; 93.3&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1771&nbsp;&nbsp; 9.1908&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 2997&nbsp;&nbsp; 2999&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1311 517.9474&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 3574&nbsp;&nbsp; 3573&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 0.4534&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 2984&nbsp;&nbsp; 2977&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1103&nbsp;&nbsp; 2.8493&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1082<br>&nbsp;&nbsp; 2991&nbsp;&nbsp; 2992&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.2281&nbsp; 61.6154&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1090<br>&nbsp;&nbsp; 2991&nbsp;&nbsp; 2993&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1982&nbsp;&nbsp; 0.3326&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1090<br>&nbsp;&nbsp; 7696&nbsp;&nbsp; 7695&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1111&nbsp;&nbsp; 0.3593&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1090<br>&nbsp;&nbsp; 7697&nbsp;&nbsp; 7695&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1111&nbsp;&nbsp; 0.3558&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1090<br>&nbsp;&nbsp; 7699&nbsp;&nbsp; 7698&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 0.1793&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 2995&nbsp;&nbsp; 2994&nbsp;&nbsp; 30.1&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 0.1096&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 2997&nbsp;&nbsp; 2998&nbsp;&nbsp; 93.3&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1771&nbsp;&nbsp; 9.1908&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 7701&nbsp;&nbsp; 7703&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.2615&nbsp;&nbsp; 2.0053&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 2997&nbsp;&nbsp; 2999&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1311 517.9474&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 3184&nbsp;&nbsp; 3183&nbsp; 103.4&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1111&nbsp;&nbsp; 2.7989&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1090<br>&nbsp;&nbsp; 3185&nbsp;&nbsp; 3183&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1111 101.8118&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1090<br>&nbsp;&nbsp; 3196&nbsp;&nbsp; 3195&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 0.2233&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 6627&nbsp;&nbsp; 6631&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.2498&nbsp;&nbsp; 0.1126&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1085<br>&nbsp;&nbsp; 3001&nbsp;&nbsp; 3000&nbsp;&nbsp; 87.3&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118 197.4325&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 3002&nbsp;&nbsp; 3000&nbsp;&nbsp; 86.8&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp; 24.5019&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 7701&nbsp;&nbsp; 7703&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.2615&nbsp;&nbsp; 2.0053&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp; 6627&nbsp;&nbsp; 6631&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.2498&nbsp;&nbsp; 0.1126&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1085<br>&nbsp;&nbsp; 3133&nbsp;&nbsp; 3131&nbsp;&nbsp; 32.2&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1113&nbsp;&nbsp; 0.1093&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1092<br>&nbsp;&nbsp; 5785&nbsp;&nbsp; 5784&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 0.2290&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; 349&nbsp;&nbsp;&nbsp; 347&nbsp;&nbsp; 31.3&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1113&nbsp;&nbsp; 0.1092&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1092<br>&nbsp;&nbsp; 6009&nbsp;&nbsp; 6004&nbsp;&nbsp; 49.2&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1105&nbsp;&nbsp; 0.1083&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1083<br>&nbsp; 10340&nbsp; 10338&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1118&nbsp;&nbsp; 0.1320&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>&nbsp; 10342&nbsp; 10341&nbsp;&nbsp; 90.0&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1145&nbsp;&nbsp; 0.1203&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.1096<br>Wrote pdb files with previous and current coordinates<br>Wrote pdb files with previous and current coordinates<br>Segmentation fault<br><br>I don't know if this is suitable here,if someone come across the same problem,please give me a hand.<br>Thank you very much for reading~&nbsp;&nbsp; ^_^<br><br>        
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