<html dir="ltr">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<meta name="GENERATOR" content="MSHTML 8.00.7600.16671">
<style title="owaParaStyle"><!--P {
        MARGIN-TOP: 0px; MARGIN-BOTTOM: 0px
}
--></style>
</head>
<body ocsi="x">
<div dir="ltr"><font color="#000000" size="2" face="Tahoma">I think you can use&nbsp;the command&nbsp;&quot;trjcat -f MD1.xtc MD2.xtc -o MD.xtc&quot;, you will get one xtc data.</font></div>
<div style="DIRECTION: ltr" id="divRpF391443">
<hr tabindex="-1">
<font size="2" face="Tahoma"><b>From:</b> gmx-users-bounces@gromacs.org [gmx-users-bounces@gromacs.org] On Behalf Of shiva birgani [sh.birgani@gmail.com]<br>
<b>Sent:</b> Monday, December 06, 2010 3:16 PM<br>
<b>To:</b> gmx-users<br>
<b>Subject:</b> [gmx-users] Crashed run<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div>Dear Justin<br>
I had a crashed run and continued it by tpbconv and mdrun. After that in order to analysis the results of new MD run I used of this command<br>
trjcat -s md2.tpr -settime <br>
But when I want to compute RMSD, DSSP, ... I do not know how I can put together the results of MD1 (crashed run) and MD2 (continued one) to have the homogeneous results.<br>
Could you please help me in this regard?<br>
thanks in advance<br>
Shiva<br>
<br>
</div>
<br>
<hr>
<font face="Arial" color="Gray" size="2">CONFIDENTIALITY: This email is intended solely for the person(s) named and may be confidential and/or privileged. If you are not the intended recipient, please delete it, notify us and do not copy, use, or disclose its
 content. Thank you.<br>
<br>
Towards A Sustainable Earth: Print Only When Necessary<br>
</font>
</body>
</html>