Dear  All  And Specially Dear Justin<br><br>I read the toturial of Umbrella Sampling.It was very useful<br>But there are afew question,of course about my work .<br>1-Is it necessary pulling one molecule along the line connecting their COMs? <br>
2-I have a protein-drug complex,it has oriented in a ordinary direction in 3D space<br>How can I say Gromacs to pul drug along that line?<br>in the other words,are there any way to rotate system to an special direction?<br>
<br>thanks in advance for your guides.<br>Mohsen<br>