Dear gromacs users <br><br>I&#39;m using gromacs 4.0.5. with following command:<br><br>g_hbond -f .xtc -s .tpr -n .ndx -num -g -hbn.<br clear="all"><br>my system contains protein, dna and water. <br><br>when I use above command for protein and dna, there is no problem. segmentation fault is only for protein and water.<br>
<br>-- <br><pre style="font-family: arial,helvetica,sans-serif;">Leila Karami<br>Ph.D. student of Physical Chemistry<br>K.N. Toosi University of Technology<br>Theoretical Physical Chemistry Group</pre><br>