<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=x-gbk" http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body text="#000000" bgcolor="#ffffff">
    On 23/12/2010 6:02 PM, gromacs564 wrote:
    <blockquote
      cite="mid:f1fccf.3692.12d1208d767.Coremail.gromacs564@126.com"
      type="cite">
      <div><span style="widows: 2; text-transform: none; text-indent:
          0px; border-collapse: separate; font: medium Simsun;
          white-space: normal; orphans: 2; letter-spacing: normal;
          color: rgb(0, 0, 0); word-spacing: 0px;"
          class="Apple-style-span">
          <pre>Hi ,

     I have obtained some files(.top,.crd,.pdb) about disaccharide via glycam web(they are glycam06 force field,included in AMBER) ,<span class="trans">&nbsp;</span> but cannot  converted this amber files to gromacs files format.</pre>
          <pre>     Can anyone help me to convert this (amber) files to gromacs input files(top or itp,gro).?

Many thanks!</pre>
        </span></div>
    </blockquote>
    <br>
    Not directly. You will need to read the underlying force field
    literature, and the relevant parts of AMBER and GROMACS manuals so
    you understand the content and file formats.<br>
    <br>
    Mark<br>
  </body>
</html>