hello ,<br><br>this is my ions.itp file for gromos53a6 forcefield<br><br>[ moleculetype ]<br>; molname    nrexcl<br>CU1        1<br><br>[ atoms ]<br>; id    at type    res nr     residu name    at name  cg nr    charge   mass<br>
1    CU1+    1    CU1        CU     1    1     63.54600<br><br>[ moleculetype ]<br>; molname    nrexcl<br>CU        1<br><br>[ atoms ]<br>; id    at type    res nr     residu name    at name  cg nr    charge   mass<br>1    CU2+    1    CU        CU     1    2     63.54600<br>
<br>[ moleculetype ]<br>; molname    nrexcl<br>ZN        1<br><br>[ atoms ]<br>; id    at type    res nr     residu name    at name  cg nr    charge   mass<br>1    ZN2+    1    ZN        ZN     1    2     65.37000<br>this  is my ions.itp<br>
<br>[ moleculetype ]<br>; molname    nrexcl<br>MG        1<br><br>[ atoms ]<br>; id    at type    res nr     residu name    at name  cg nr    charge   mass<br>1    MG2+    1    MG        MG     1    2     24.30500<br><br>
[ moleculetype ]<br>; molname    nrexcl<br>CA        1<br><br>[ atoms ]<br>; id    at type    res nr     residu name    at name  cg nr    charge   mass<br>1    CA2+    1    CA        CA     1    2     40.08000<br><br>[ moleculetype ]<br>
; molname    nrexcl<br>NA        1<br><br>[ atoms ]<br>; id    at type    res nr     residu name    at name  cg nr    charge   mass<br>1    NA+    1    NA        NA     1    1     22.9898<br><br>[ moleculetype ]<br>; molname    nrexcl<br>
CL        1<br><br>[ atoms ]<br>; id    at type    res nr     residu name    at name  cg nr    charge   mass<br>1    CL-    1    CL        CL     1    -1     35.45300<br><br><br><br><br>for adding ions I used this command ...<br>
<br>genion -s ions.tpr -o system_solv_ions.gro -p grompp.top -pname NA+ -np 11 -nname CL-<br><br>now when I m doing EM then getting this error <br><br>grompp -f minim.mdp -c system_solv_ions.gro -p grompp.top -o em.tpr<br>
<br>Fatal error:<br>No such moleculetype NA+<br><br><br>help me !<br><br>regards:<br>shikha<br><br>