<html dir="ltr">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<meta content="MSHTML 6.00.2900.3268" name="GENERATOR">
<style title="owaParaStyle"><!--P {
        MARGIN-TOP: 0px; MARGIN-BOTTOM: 0px
}
--></style>
</head>
<body ocsi="x">
<div dir="ltr"><font face="Tahoma" color="#000000">ref_t at 318K </font></div>
<div id="divRpF657318" style="DIRECTION: ltr">
<hr tabindex="-1">
<font face="Tahoma" size="2"><b>From:</b> gmx-users-bounces@gromacs.org [gmx-users-bounces@gromacs.org] On Behalf Of swagata chakraborty [swagata.chakraborty@gmail.com]<br>
<b>Sent:</b> Tuesday, December 28, 2010 3:17 PM<br>
<b>To:</b> gmx-users@gromacs.org<br>
<b>Subject:</b> [gmx-users] MD simulation at 318K<br>
</font><br>
</div>
<div></div>
<div><br>
<div class="gmail_quote"><br>
Hi,<br>
&nbsp;I want to execute MD simulation of my Protein at 318K. Should I keep ref_t at 300K and gen_temp at 318K in the pr.mdp and md.mdp files? Do I need to change any other parameters as well.
<br>
<br>
Thanks in advance,<br>
<br>
Regards,<br clear="all">
<font color="#888888">Swagata Chakraborty<br>
Research Scholar,<br>
Department of Chemical Sciences,<br>
Tata Institute of Fundamental Research, <br>
Mumbai-400005<br>
<br>
</font></div>
<br>
</div>
<br>
<hr>
<font face="Arial" color="Gray" size="2">CONFIDENTIALITY: This email is intended solely for the person(s) named and may be confidential and/or privileged. If you are not the intended recipient, please delete it, notify us and do not copy, use, or disclose its
 content. Thank you.<br>
<br>
Towards A Sustainable Earth: Print Only When Necessary<br>
</font>
</body>
</html>