<DIV>Hi expert,</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>I'd like to add sufactant to water. That means i should first get the sufactant.gro, and sufactant.top.</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>Someone said that we cannot get sufactant.gro and sufactant.top through grompp ()&nbsp; sufactant.pdb. Because grompp&nbsp; .pdb could mainly use for macro-biology big moleculars, which means some proteins etc.</DIV>
<DIV>So that means we could not get correct&nbsp;&nbsp;.gro, .top small molecules such as inorganic or small organic molecules (such as <A class="blue12other" href="http://dict.youdao.com/search?q=ethanol&amp;keyfrom=E2Ctranslation"><FONT color="#0022cc">ethanol</FONT></A>).</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>So how can we get the sufactant.gro, sufactant.top? and which force field should we choose for ordinary simulation? I know we often use ffoplass force field for solution.</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>Tiefeng</DIV><br><br><span title="neteasefooter"><span id="netease_mail_footer"></span></span>