<div>Hi all,</div>
<div>I have the following error in grompp before energy minimization: </div>
<div>No such moleculetype SOL</div>
<div>I have used grep to count the methanol molecules and added SOL 291 comment in .top file to tell the number of methanols.</div>
<div>What is missing there?</div>
<div> </div>
<div>Note: I  have used pdb2gmx -f xxx.pdb , that is, I haven&#39;t added anything like in water simulation  -water tip3p. Should we add something  to tell the gromacs that it is methanol simulation?</div>
<div> </div>
<div>best wishes</div>
<div>mustafa</div>