Justin,<br><br>Are you sure? I installed 4.5.3 and tried Methanol, MTH, MeOH.<br><br>Nothing changed. I suggest you to try it by yourself. <br>Don&#39;t try to remind people the help rules. <br>JUST HELP OR DONOT HELP. <br>
<br>mustafa<br><br><br>This topology defines the [moleculetype] name as &quot;Methanol,&quot; which is the name<br>
that needs to be used in the [molecules] directive below.  But then, too, you&#39;re<br>
not using the same residue name either (MTH instead of MeOH), so it is still not<br>
possible to say what&#39;s going wrong.<br>
<br>
-Justin<br>