<br><br><div class="gmail_quote">2010/12/26 ms <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:devicerandom@gmail.com">devicerandom@gmail.com</a>&gt;</span><br><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">
<div class="im"><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;"><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">

On 25/12/10 02:12, Qin Qiao wrote:<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">
Thanks a lot!<br>
<br>
It says Nose-hoover coupling generates the correct canonical ensemble, and<br>
that&#39;s the reason why I used it. I wonder whether v-rescale can also get<br>
the<br>
correct ensemble. Could you tell me?<br>
<br>
</blockquote>
<br>
As far as I know v-rescale should generate a correct ensemble.<br>
</blockquote></blockquote>
<br></div><div class="im">
On 25/12/10 12:40, Qin Qiao wrote:<br>
&gt; I&#39;m not sure, since actually kinetic energy should have fluctuation, and the<br>
&gt; v-rescaling may suppress the fluctuation..<br>
&gt;<br>
<br></div>
(PLEASE don&#39;t top post!!)<br>
<br>
Well, the thermostat author, who I happen to know, says it generates the right ensemble. :) I&#39;m not an expert so I can&#39;t say if it&#39;s true, but if you like you can read the original papers, linked here:<br>
<br>
<a href="http://sites.google.com/site/giovannibussi/Research/algorithms#TOC-A-stochastic-velocity-rescaling-the" target="_blank">http://sites.google.com/site/giovannibussi/Research/algorithms#TOC-A-stochastic-velocity-rescaling-the</a><br>

<br>
cheers,<div><div></div><div class="h5"><br>
m.<br>
<br></div></div></blockquote><div>Thanks a lot!<br><br>Qin <br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;"><div><div class="h5">
-- <br>
Massimo Sandal, Ph.D.<br>
<a href="http://devicerandom.org" target="_blank">http://devicerandom.org</a><br>
-- <br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br>
</div></div></blockquote></div><br>