<br><br><div class="gmail_quote">2011/1/10 Camilo Andrés Jimenez Cruz <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:camilo.jimenezc@gmail.com">camilo.jimenezc@gmail.com</a>&gt;</span><br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">

Hi list!<div><br></div><div>it has been discussed in other posts the inconvenience of PBCing after rotating (see example: <a href="http://oldwww.gromacs.org/pipermail/gmx-developers/2009-November/003754.html" target="_blank">http://oldwww.gromacs.org/pipermail/gmx-developers/2009-November/003754.html</a>), I just want to know what is the state of this problem and if somebody has found a satisfying solution.</div>



<div><br>I also wonder if it has been considered the idea of doing PBC  *at the same time* that the rotation is made, In my view, this would fix the problem. no?</div></blockquote><div>No. At the same time doesn&#39;t make sense. You need one reference frame to do PBC. And it can&#39;t be rotated. In most cases (I give one example in the mail you linked where this is not the case) you can do first PBC and than fit.</div>

<div><br></div><div>Roland</div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;"><div> </div></blockquote><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex;">

<div><br></div><div>Thanks!<br clear="all"><br>-- <br>

Camilo Andrés Jiménez Cruz<br><br>
</div>
<br>--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>ORNL/UT Center for Molecular Biophysics <a href="http://cmb.ornl.gov">cmb.ornl.gov</a><br>

865-241-1537, ORNL PO BOX 2008 MS6309<br>