<div>Hi all,</div>
<div> </div>
<div>I am minimizing my protein (230 amino acids)  with the minim.mdp file given in the lysozyme tutorial but I am not getting a stable graph .. I checked the manual also to look for parameters but I am not able to find such information there apart from the theory about the minimzation algos and process.. So can anybody direct me to some relevant link or help me out in this regard ??</div>

<div> </div>
<div><br clear="all"><br>-- <br>Bharat<br>Ph.D. Candidate<br>Room No. : 7202A, 2nd Floor<br>Biomolecular Engineering Laboratory<br>Division of Chemical Engineering and Polymer Science<br>Pusan National University<br>Busan -609735<br>
South Korea<br>Lab phone no. - +82-51-510-3680, +82-51-583-8343</div>
<div>Mobile no. - 010-5818-3680<br>E-mail : <a href="mailto:monu46010@yahoo.com" target="_blank">monu46010@yahoo.com</a></div><br>