Hi All,<br><br>I have performed an umbrella sampling simulation, and calculated the error via bootstrapping method implemented in the Gromacs. I used the following command line :<br><br><br>Here, -bsres option gives an output file (bsResult.xvg) with average potential values and corresponding standard errors depending on the block size used and number of bootstraps. I could not find a way to calculate the error for the umbrella sampling simulation by means of that output file.  <br>
<br>Thanks in advance<br><br>-- <br><span style="color: rgb(153, 153, 153);">----------------------------------------------------------------------------<br>Ozge Engin<br>Department of Computational Science &amp; Engineering</span><br style="color: rgb(153, 153, 153);">
<span style="color: rgb(153, 153, 153);">Koc University, Turkey<br>Phone:+902123381542<br style="color: rgb(153, 153, 153);"></span><br><br>