
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">

<html>

  <head>


    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=ISO-8859-1">

  </head>

  <body text="#000000" bgcolor="#ffffff">

    Dear All:<br>

    <br>

    I am trying to build a lipid bilayer made of DMPC (<span

      style="visibility: visible;" id="search">Dimyristoylphosphatidylcholine)

      surrounding a putative membrane channel. Everything goes well

      until I come across with the use of pdb2gmx and further on to the

      use of gromp, where I realized that I need to add some information

      about DMPC, information that is supposed to be in the rtp format.<br>

      <br>

      I have no idea how to build such rtp file for DMPC. I have read

      and practiced with all tutorials about the construction of lipid

      bilayer with GROMACS. I have also read the relevant information

      about rtp files in the GROMACS Manual. However, I still cannot

      figure out how to do this.<br>

      <br>

      I will appreciate very much any help provided. I am stuck and

      would like to learn how to create an rtp file from scratch, which

      I am sure I need to do more than once during this project...<br>

      <br>

      Much obliged,<br>

      Ramon Garduno<br>

    </span>

  </body>

</html>