<div>It means that  rmsd plot is stable .. I am trying to run the trajectory in windows using VMD and for that i followed what was said in past thread of gmx discussion list but I am not able to run the trajectory and for that I have posted another question regarding that jus 5 mins back..</div>

<div> </div>
<div>Also if u can shed some light of this very important issue ... that to learn simulation in gromacs and to analyze the things needed for our analysis .. what exactly do we need to do .. as in my case i am following ur tutorial and asking doubts in the gmx user list but I am not able to get many things still ... like analysing the plots and graphs and how to tell whch value is correct at what particular time for how much simulation time ?? ... pls do ket me know how can I have a firm grip in this regard...</div>

<div> </div>
<div><br>-- <br>Bharat<br>Ph.D. Candidate<br>Room No. : 7202A, 2nd Floor<br>Biomolecular Engineering Laboratory<br>Division of Chemical Engineering and Polymer Science<br>Pusan National University<br>Busan -609735<br>South Korea<br>
Lab phone no. - +82-51-510-3680, +82-51-583-8343</div>
<div>Mobile no. - 010-5818-3680<br>E-mail : <a href="mailto:monu46010@yahoo.com" target="_blank">monu46010@yahoo.com</a></div><br>